Bussen, der kørte mellem Lille i det nordlige Frankrig og den belgiske hovedstad Bruxelles, blev standset i byen Wetteren, nær Gent.
Politiet anholdt derefter tre passagerer og afhørte alle om bord for at finde ud af, om de mistænktes samtale var berettiget.
En talsmand for justitsminister Paul Van Tigchelt sagde, at passageren hørte en formodet "terroristsamtale" og alarmerede politiet.
Efter at bussen blev inspiceret, sagde den belgiske føderale anklagemyndighed, at den i øjeblikket ikke anser hændelsen for at være et tilfælde af terrorisme.