Seks udenlandske turister mistede livet, mens 39 andre blev reddet op af havet.
Ulykken har udløst bekymring om sikkerheden ved populære turistaktiviteter i Egypten.
Dødsulykke under koralrevstur
Ubåden, som tilhørte firmaet Sindbad Submarines, var på en rutinemæssig tur for at vise turisterne livet på havbunden og de farverige koralrev, da den sank cirka én kilometer fra kysten.
Ifølge CNN har den russiske ambassade og egyptiske myndigheder oplyst, at flertallet af de ombordværende russiske turister, herunder syv børn i alderen to til femten år.
Ulykken fandt sted klokken 10.00 lokal tid.
Ifølge det statslige russiske medie RIA Novosti blev i alt 21 personer, herunder børn, efterfølgende indlagt på hospital.
De seks omkomne var alle udenlandske statsborgere.
De præcise omstændigheder bag ulykken er endnu uklare, men redningsarbejdet blev sat hurtigt i gang, og flertallet af passagererne blev reddet i live.
Sikkerhedsforholdene på ubåden bliver nu undersøgt nærmere.
Erfaren operatør
Ifølge selskabets egen hjemmeside er ubådene konstrueret i Finland og certificeret til at modstå tryk ned til 75 meters dybde.
De beskrives som sikre og pålidelige, med iltmasker og redningsveste til rådighed.
Virksomheden, som driver to turistubåde i Hurghada, har markedsført sine ture som familievenlige og komfortable med plads til 44 passagerer og mulighed for at se 500 meter af koralrevet på 25 meters dybde.
Ulykken sætter nu fokus på sikkerheden i Egyptens turismesektor, som er en af landets vigtigste indtægtskilder.
